引起新生儿胸口凹陷的原因主要包括漏斗胸、正常生理现象，具体如下：

1、漏斗胸：如果新生儿有维生素D缺乏性佝偻病，就会导致漏斗胸，这种情况非常常见。新生儿生长发育非常迅速，如果没有注意及时补充维生素D或者平时晒太阳次数非常少，就会导致其体内缺乏维生素D，引起肠道内钙的吸收明显下降，钙吸收、合成的减少会引起骨骼钙化不全，导致胸口凹陷；

2、正常生理现象：新生儿年龄比较小，肋间肌发育不太成熟，可能会出现随着呼吸而出现胸口凹陷，这种情况会随着年龄增大而逐渐好转。