导致胎儿畸形的原因有：1、可能是遗传基因导致的畸形，如近亲结婚时，孩子的遗传疾病发病率更高，遗传因素导致的胎儿畸形大约占十分之一。2、在怀孕期间如果没有正确用药会对胎儿造成不可逆的不良影响，很多药物虽然能治病，但也具有毒副作用，胎儿很容易受到毒副作用的影响而致畸，怀孕期间需要慎用药物，在医生的指导下用药。3、当孕妇患有某些疾病时，比如风疹病毒感染、弓形虫感染，会增加胎儿畸形的风险。4、如果孕妇的生活工作环境不安全，受放射线、重金属元素等影响容易导致胎儿基因突变或发育异常引起畸形。