治疗扁平疣的药膏，包括如下：

1、抗病毒的软膏，比如重组人干扰素α-2b软膏、咪喹莫特软膏。

2、去角化的药膏，比如维A酸软膏、他扎罗汀软膏。在治疗期间还可以口服匹多莫德口服液、香菇菌多糖片这样的免疫调节类药物。

还可以口服中药，主要成分包括马齿苋、红花、赤芍、板蓝根、大青叶、木贼、香附煎水200ml，2次/日口服。另外，还可以选择冷冻、电离子、二氧化碳灼烧术这样的方法来进行物理治疗，在治疗期间需要涂抹夫西地酸乳膏，以预防相应的感染情况发生，并且扁平疣有外伤或者搔抓抓破，以免引起同形反应，促使皮疹的加重和扩散。