肛门从结构上始于齿状线，止于肛缘，是消化道的最末端，以及人体与外界的接口处，为解剖学意义上的肛管，肛门从直肠底部开始，是结肠的最后部分。以齿状线为界，是直肠与肛门的分界，与之相邻的器官，前方位置为前列腺及尿道，女性为子宫及阴道，后方为尾骨。周围结构上环绕筋膜类坚韧组织，肛管上方被内括约肌围绕，下方被外括约肌形成的肛门包围。

主要作用在于通过收缩和放松来封闭和打开肛门，帮助控制粪便，避免渗出或将粪便排出体外。肛门由于特殊结构及所处环境、感染、污染的几率，远高于其他身体器官，需注意保持清洁卫生。