咽口水时喉咙痛，临床上可能有以下的情况：

1、咽喉部的急性炎症感染，常见的有急性咽喉炎、急性化脓性扁桃体、扁桃体周围炎、扁桃体溃疡、疱疹性咽峡炎、急性会厌炎等相关类型的疾病，主要是有炎症感染，导致患者吞咽的时候出现咽喉部疼痛感，当炎症控制好了之后，患者吞咽的疼痛感就能明显缓解。

2、慢性咽喉炎，一般疼痛感不会太剧烈，但持续时间会比较久，可以适当应用清咽利嗓的含片或喷剂缓解不适症状，同时要注意清淡饮食，戒烟戒酒，调整健康科学的生活习惯。

3、咽喉部长东西，常见的有扁桃体癌、下咽癌，声门上型喉癌比如会厌癌局部糜烂、破溃，当患者吞咽的时候，食物残渣与糜烂、破溃的地方发生摩擦可以出现疼痛感，疼痛感是固定的，药物治疗没有效果。

总而言之，患者吞咽口水时喉咙痛，建议患者上耳鼻喉科门诊完善咽喉部的检查，必要时完善咽喉部电子喉镜、咽喉部CT等相关的检查。