香砂六君丸主要的功效是可以益气健脾、和胃，用于治疗脾虚气滞导致的消化不良、脘腹胀满、大便溏稀这样的症状。这个药物中的党参起到大补元气，还有益气、健脾、养胃的作用。

白术可以健脾燥湿、加强益气的作用；茯苓可以健脾渗湿；陈皮、半夏可以燥湿化痰；木香、砂仁可以行气调中止痛；炙甘草来益气和中，还可以调和诸药。现在研究这个药物有调节胃液分泌、保护胃黏膜、调节胃肠运动这样的作用，但是需要注意的是，急性胃肠炎患者是不适用的，另外口干、大便干燥，这样的患者也是不适用的。