乳腺囊肿无特效的药物进行治疗，中药治疗有一定的效果。中药是以活血化瘀、散结止痛以及疏通乳腺管治疗为主，西药是以激素类药物为主，中药与西药不建议同时服用。

囊肿较小以及情况较好的囊肿，中药治疗较好，通过疏肝理气、活血化瘀、散结止痛，可以控制囊肿的生长速度以及达到控制囊肿的作用，若较大的包块服用西药效果较好，以及采用西医的手术治疗。情况较差的囊肿中药和西药也可以配合使用，饭后可以先服用西药，然后间隔1-2个小时再配合中药辅助治疗，中西医结合治疗会对囊肿起到更好的治疗效果。