六味地黄丸与五子衍宗丸的区别在于一个是治疗肾阴虚的，一个是治疗肾阳虚的。六味地黄丸的功效，主要是滋阴补血、益精填髓，主要用于劳累过度引发的肾亏，常见的症状有腰膝酸软、无力，手足心热、潮热盗汗、失眠多梦等，用于治疗性生活过度引起的腰疼以及男性阳痿、早泄，女性性冷淡等疾病的辅助治疗。

而五子衍宗丸的功效是补肾益精，用于肾虚精亏所致的阳痿、不育、遗精、早泄、腰疼、尿后余沥等，需要在专业医生的指导下辨别病症，再给予相应的药物进行治疗，且不可盲目用药。