主动脉缩窄手术具有一定危险，主动脉供应全身血液，如同电路，出现异常后，冰箱里食物就会过期，电视不能观看，网络也不能连接，因此人可出现烦躁及焦虑情绪。主动脉缩窄手术花费时间较长、创伤较大，具有一定风险，手术死亡率约为0%-4%，死亡原因为出血和心功能不全。

但若患者不进行手术，90%患者可出现心力衰竭或缩窄段远、近端瘤样扩张，形成动脉瘤、心脏内感染或出现脑出血，患者寿命一般不超过50岁。现统计主动脉缩窄平均寿命在30-40岁间，若患者狭窄段两端压力出现22.5mmHg阶差，需立即进行手术。