青霉素与红霉素的区别主要在于作用机制不一样，对其敏感的细菌也不一样。

青霉素是β-内酰胺类抗菌药物，青霉素进入细胞体后可以通过抑制细菌细胞壁的合成，造成细菌的重要物质外漏而起到杀灭细菌的作用，因此青霉素属于杀菌剂。青霉素主要对溶血性链球菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、梭状芽孢杆菌、消化链球菌具有良好的杀菌作用，但对肠球菌的杀菌作用一般。对衣原体、支原体、放线菌、奈瑟菌以及厌氧菌的抗菌作用较弱，临床上青霉素主要用于治疗上述敏感菌引起的呼吸道感染、皮肤感染以及泌尿系统感染。

红霉素属于大环内酯类抗菌药物，主要通过抑制细菌蛋白质的合成而起到抗菌作用，因此红霉素属于抑菌剂。红霉素对于金黄色葡萄球菌、链球菌、白喉杆菌、流感嗜血杆菌、军团菌、奈瑟菌、衣原体跟支原体具有良好的抗菌活性，临床上红霉素主要用于治疗上述敏感菌引起的肺部感染以及皮肤黏膜组织感染。