如果高原反应后后脑勺隐隐作痛，通常可以做如下处理：

第一、最常见的隐痛原因是大脑乏氧，在高原时最容易出现的疾病是乏氧类的疾病，此时因二化碳分压过高，氧分压过低，动脉血氧饱和度严重不足而导致通气血流比例失衡，这时应该迅速行氧疗治疗。在有条件的情况下，可以就近行屏蔽氧或者吸氧气袋、氧气瓶进行治疗。

第二、最常见的原因还有大脑血管缺血而导致隐痛，通常椎基底动脉和颈内静脉系统供血不足会引发隐隐作痛的情况。此时可以应用改善脑血管缺血、痉挛的药物，例如可服用盐酸氟桂利嗪胶囊、尼莫地平片等进行缓解。

第三、心脏供血不足也会导致后脑的疼痛，此时可以服用补气益血的药物，例如丹参、红花、红景天等都可以缓解上述症状。