肛门伤口不愈合有可能存在异物残留、创面化脓感染，如果患有全身性疾病，比如糖尿病等，也会影响肛门的愈合，建议最好去肛肠外科检查，根据检查情况对症处理。对于创面化脓感染引起的伤口不愈合，建议可以清创处理，去掉脓液及其感染的组织，有利于新的组织生长，促进伤口愈合；异物残留引起的伤口不愈合，要去除异物，清洁消毒局部皮肤黏膜。

同时要注意肛门部位的卫生，每次大便后清洁肛门，也可以用复方苦参洗剂或者1:5000的高锰酸钾溶液坐浴，局部涂抹京万红软膏、京万红痔疮膏、莫匹罗星软膏等。