直肠指检是肛肠科医生最主要的一种检查方法，是用右手戴上手套，食指涂上石蜡油由肛门进入直肠。首先感觉肛门口松紧度，看有没有松弛，有没有肛门狭窄、紧张，然后再往里进入看有没有发生肿物、肿瘤、硬结，再观察指套上有无出血、黏液。通过指诊很多疾病都能发现，比如息肉、肛乳头瘤、直肠癌等疾病。

肛门指检除小孩、幼儿因为肛门比较小，医生指头比较粗不太适合外，其他患者都可以做肛门指诊，指诊不会造成损伤，而且可以发现很多不能发现的疾病。