肛瘘手术后医生往往嘱咐患者要排便后坐浴，坐浴有中药坐浴、温盐水坐浴，用温水直接把肛门洗净。以上几种坐浴作用都不同，但大同小异。患者可以自己将药液或者水温设置在37-38℃左右，坐在水盆里，如此冲洗可以使创面清洁，也可使创面受到药液刺激，刺激肌肉生长，对伤口具有保养作用。但要求坐浴时间不要太长，一般不要超过15分钟，因为过长时间坐浴会使伤口肉芽组织受到刺激或过度增生，使伤口愈合缓慢。

需要提醒患者注意，在坐浴时以药液泡洗为主，避免搓洗，避免用纱布擦拭伤口，否则会影响伤口生长，而且过度熏洗会引起伤口生长缓慢，达不到真正坐浴的作用。在伤口愈合后期可以减少坐浴次数，在肛瘘伤口脓液较多的前1-2周，坐浴十分有利。