甲状软骨囊肿是甲状腺中比较常见的囊肿样病变，较小的甲状软骨囊肿往往没有明显的临床症状。但是，如果甲状软骨囊肿患者合并有甲状腺功能异常，可能会有焦虑、躁动、易怒等甲状功能亢进的症状，或者伴有乏力、精神不振、萎靡、下肢肿胀等甲状腺功能减弱的症状。

通常体积超过四公分以上的甲状软骨囊肿会有明显的压迫症状，患者会出现呼吸困难、吞咽困难。如果较大的囊肿压迫到喉返神经，患者会出现声音嘶哑等相关症状。