腔黏液囊肿一般在门诊就可以完成手术。一般术前会注射局麻药物，以确保患者整个手术过程中无痛。然后在囊肿边界范围外做手术切口，切除囊肿及囊肿下的黏液腺。一定要将黏液腺一起摘掉，否则囊肿容易复发。通常黏液腺摘除干净后复发几率会大幅下降。术后通常需要缝线，一般7-10天后拆线。

手术之前往往需要清洁口腔，如漱口及消毒准备等。门诊手术的患者不要空腹进行手术，一般要吃早餐，如果下午做手术一般要吃午饭。