儿童患有隐睾症的后果是比较严重的。一般来说，会有以下几方面的后果：

第一、会导致疝气，90%的睾丸会将病人鞘状突未闭。鞘状突通常是在睾丸下降后和出生后第一个月内闭合，鞘状突未闭合伴有更高的风险，会引起疝气的发生。

第二、儿童隐睾有可能会导致睾丸扭转。所以，如果确诊隐睾，建议尽早的手术治疗。

第三、有可能会导致不育症。隐睾会导致生殖细胞受损，及早的做手术使睾丸固定于阴囊，可以减少生育能力下降的发生风险。隐睾症最早期的产后组织学异常是在出生后第一个月，即可观察到间质细胞发育不良。青春期之后的单侧隐睾应予以摘除，因为其在将来可能发生恶变或扭转，绝大部分睾丸都丧失了生育能力。

第四、隐睾有可能会导致恶变，有过隐睾症的男性中，生殖细胞肿瘤的发病率是正常人的40倍。睾丸未降的位置影响睾丸发生肿瘤的相对风险，位置越高，恶变的风险越大，一半的腹腔内睾丸会发生恶变，睾丸所导致的睾丸肿瘤类型中最常见的精原细胞瘤。隐睾中患者原位癌的发病率是1.7%。