医学上将间质瘤不进行良恶性分级，而进行危险度分级，按照NIH2008的分级标准，将胃间质瘤分为极低危、低危、中危、高危类型，中危、高危间质瘤术后需要进行辅助的靶向治疗；

极低危、低危组间质瘤，可以认为其属于良性肿瘤，患者不需术后辅助靶向治疗也可治愈，发生转移、复发的几率较低。中高危患者通过术后规范的辅助治疗，大部分患者也能治愈。