菌阴肺结核也是需要治疗的，只是菌阴肺结核可能传染性不是很强，但是只要确诊为肺结核，都是需要规范长期的予以抗结核治疗，而且疗程要足，为6-9个月。

在规范的抗结核治疗之后，也建议要复查肺部CT看病灶是否吸收好转，同时也要查痰，看是否痰结核杆菌已经消失。肺结核主要是因为感染了结核分枝杆菌，而出现肺部的一种非特异性炎症，是一种急性呼吸道传染病，主要是通过呼吸道飞沫传播，发病主要决定于人体的免疫力。