他克莫司分为口服和外用两种类型，口服的他克莫司摄入体内之后可能会造成头晕、头痛、恶心、呕吐、全身发热等诸多系统性副作用，而个别人会造成红斑、丘疹、全身性的瘙痒、发热等现象。

而外用的他克莫司涂抹在皮肤表面，可能会对局部皮肤造成刺激，出现红肿、灼热、瘙痒，个别人会出现糜烂、渗出等症状。所以他克莫司这种药物用于人体后，一旦出现副作用立刻停止使用该种药物，更换其他可替代的药物进行治疗疾病。