红色毛癣菌感染早期，若患者皮肤受感染的面积较小，则单纯的使用外用药物治疗即可将其根除，比如市场上有很多外用抗真菌制剂，咪康唑、酮康唑、特比萘芬、环吡酮胺等，大部分情况下均可将早期的红色毛癣菌感染完全治愈。

但是随着时间的延长，感染的面积不断扩大，部分患者在没有治疗的情况下，症状会自行缓解或者减轻，时间较长以后很难完全分辨健康的皮肤与受感染的皮肤，也有一部分感染会造成角质化，角质增厚，单纯使用外用药物很难渗透到病菌感染的部位，若感染到指甲，外用药物则更难渗透到受感染的部位，此时则需口服药物治疗，方可将红色毛癣菌完全清除。