细菌感染和真菌感染的区别在于病原体不同、感染途径不同、引起的疾病不同、临床症状不同、治疗措施不同等，两种是不同的疾病，需要进行鉴别。

1、病原体不同：细菌感染常见的病原体包括金黄色葡萄球菌、链球菌、肺炎球菌等。真菌感染常见的病原体包括黄癣菌、白癣菌、红色毛癣菌等。

2、感染途径不同：细菌感染可通过呼吸道传播、消化道传播等，免疫力低下的人群、菌群紊乱的人群等比较容易感染细菌。长期大剂量使用糖皮质激素、食物变质，以及糖尿病患者、肾衰竭患者等是真菌感染的易患因素。

3、引起的疾病不同：细菌感染可引起毛囊炎、上呼吸道感染、肺炎、细菌性阴道病等。真菌感染可引起头癣、体癣、外阴阴道假丝酵母菌病等。

4、临床症状不同：细菌感染可引起病变部位红、肿、热、痛，还可能会伴有咳嗽、头痛等。真菌感染可引起瘙痒、红斑、鳞屑、水疱、糜烂等。

5、治疗措施不同：细菌感染的患者可遵医嘱使用阿奇霉素片、青霉素V钾片、头孢羟氨苄胶囊等抗生素。真菌感染的患者需要在医生指导下使用抗真菌药物，如酮康唑乳膏、伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等。

除了上述区别外，这两种感染在预后、预防方式等也存在不同。若患者出现不适症状后，应及时到医院就诊。​