十二指肠球部溃疡的临床表现多样化，有的表现为上腹部疼痛或者放射到背后的疼痛，有的无症状，有的为饥饿痛或夜间痛，进食后疼痛缓解，也有极个别患者表现为上腹饱胀感、恶心、呕吐、嗳气或出现黑便。

更严重的可能出现呕血，甚至引起十二指肠球部穿孔而导致腹部剧烈疼痛；有些患者的溃疡可引起幽门或球部狭窄导致反复呕吐。