结肠炎时肠道黏膜细胞会有水肿、变性等改变，黏膜的通透性就会增加，可以有比较多的蛋白质等大分子物质渗透到肠腔内，白细胞也因为炎性物质的吸引，从肠壁内渗透到肠腔内。这些渗入到肠腔内的白细胞和蛋白质成分，不能被结肠吸收，就可以在肠道内细菌的作用下，聚集形成黏液样改变，黏液便提示有结肠的炎性改变，不能确定是细菌性感染，还是结肠的免疫功能紊乱所致。

有黏液便时应该进一步做大便常规检查，必要时做大便培养和肠镜检查，分析结肠炎的种类，感染所致可以用氟哌酸等药物治疗，溃疡性结肠炎可以用柳氮磺嘧啶治疗。