喉咙上有水疱考虑有可能是疱疹性咽峡炎，疱疹性咽峡炎是由柯萨奇A型病毒感染所致，常常在儿童中发病，但是当成年人抵抗力下降的时候也会出现这种疾病。该病临床上往往表现为发热、喉咙肿痛，检查时可以发现咽喉部有红色的丘疹，从而引起喉咙部剧烈的疼痛。

在治疗上，疱疹性咽峡炎有自愈性，即使不服用药物也可以自行的缓解。但是如果疼痛明显伴有发热，可以口服抗病毒的药物，如利巴韦林等。在饮食上需要注意清淡饮食，食用易消化、质软的食物。