女性的霉菌性尿道炎可以局部使用两性霉素B等抗真菌的药物进行治疗，如果症状较重还可以口服伏立康唑等全身性的抗真菌药物进行治疗。另外，还可以通过服用碳酸氢钠片等碱性药物来碱化尿液，帮助抗霉菌的治疗。

女性的霉菌性尿道炎，还要同时注意是否合并有霉菌性阴道炎的情况，如果有要及时进行治疗，避免反复交叉感染。如果有性伴侣，双方都要同时进行抗真菌治疗。如果要预防女性的霉菌性尿道炎，一定要注意多饮水、多排尿并且注意个人卫生，要及时去治疗妇科的感染，以避免长期、反复的感染导致感染的慢性化或者耐药情况的发生。