室间隔缺损封堵手术后的后遗症主要有以下几个：

1、手术以后早期可能发生封堵器的脱落。

2、可能会出现的溶血反应，严重的可以导致急性肾功能衰竭，因此在手术以后需要进行定期做血和尿液的常规检查。一旦发生溶血反应引起肾功能受损，要及时的给予透析治疗，严重的需要取出封堵器。

3、可能会出现残余分流，分流比较多的情况下需要再次封堵或者开胸手术。

4、可能会引起传导系统受累，导致一过性的或者永久性的房室传导阻滞，严重的可能需要安装永久性的心脏起搏器。

所以室间隔缺损封堵后，要密切观察有没有并发症的出现，及时做出处理。