支原体感染导致高烧39度到40度，还是需要进一步的明确支原体的药物敏感性，选择最敏感的抗菌素，一般是阿奇霉素，可以静脉输液治疗来控制支原体的感染，同时如果高烧不退，可以口服一些退烧药，比如布洛芬胶囊，对乙酰氨基酚胶囊或者是疏风退热颗粒。

由于支原体很容易反复，所以必须要足够疗程，等到体温完全正常5~7天以后才可以停药。