通常苯扎氯铵可以杀死真菌，苯扎氯铵属于一种具有广谱高效的杀菌灭藻能力的药物，苯扎氯铵对革兰氏阳性细菌具有较强的杀灭效果，必须在医生指导下使用，避免自行用药，以免出现不良后果。

苯扎氯铵是一种阳离子表面活性剂，属于非氧化性杀菌剂，具有广谱和高效杀菌的效果，能改善细菌胞浆膜通透性使菌体胞浆物质外渗，也能阻碍其代谢，而起到杀灭的作用，可用于改善多种病原菌滋生的效果，也能达到杀灭真菌组织的作用。苯扎氯铵对革兰氏阳性细菌有较强的杀灭效果，对绿脓杆菌或抗酸杆菌、细胞芽孢等效果不佳。在皮肤出现真菌感染疾病之后，可以通过外用涂抹的方法达到杀灭病原体的效果，可以改善皮肤感染所引起的临床症状。

苯扎氯铵属于外用溶液，通常不会对皮肤造成较大刺激，但如果患者反复使用或超剂量使用后可能会出现过敏反应，导致皮肤出现红疹和丘疹，还可能会造成瘙痒感，用于滴眼液时还可能会导致变态反应性结膜炎和视力减退等症状，在使用期间需要密切关注是否出现不良反应。