宫外孕当中大约95％是输卵管妊娠。输卵管妊娠是输卵管通而不畅造成。吸烟、做过盆腔手术、流产手术、辅助生殖怀孕，宫内节育器避孕失败怀孕，或口服紧急避孕药后怀孕等，都会引起宫外孕的发生。
正常的怀孕是精子和卵子在输卵管的一个特殊的位置，壶腹部相遇，然后受精之后，受精卵从输卵管壶腹部，逐渐往子宫里面移动，然后着床在子宫腔里面。当女性的输卵管不通畅的时候，受精卵向子宫腔里面移动的过程，就受到阻碍，受精卵就着床在输卵管里面并发育，而没有进入到宫腔，这就发生了宫外孕。输卵管不通畅的原因有几种，最常见的是输卵管的慢性炎症，造成的输卵管不通畅。
输卵管炎症通常是女性生殖系统的炎症，就是引起的输卵管不通畅，可以是输卵管内腔的不通畅，也可以是输卵管跟周围组织粘连，造成的输卵管不通畅，这是常见的原因。另外也有少部分女性是由于输卵管先天的发育的异常造成的不通畅，比如说输卵管太长或者太短。还有一种情况就是女性有盆腔的子宫内膜异位症，子宫内膜异位症，有可能造成盆腔粘连。如果引起输卵管跟周围组织的粘连，也有可能造成输卵管不通畅。
