长效干扰素治疗乙肝的效果还是不错的，一般如果能正常应用长效干扰素，临床治愈率在30%-50%，但没有核苷类似物抗病毒治疗效果更高。但是这两种抗病毒药各有缺点、优点，长效干扰素的缺点主要是应用不是很方便，而且还存在着一些干扰素的禁忌证，也就不能应用了。在应用长效干扰素的过程中，需要定期监测血常规、肝功能、甲状腺功能等相关指标，同时存在一些明显的不良反应，比如类流感样症状以及骨髓抑制等。

但是对于一些表面抗原定量比较低，乙肝病毒DNA含量也比较低，年轻的患者，也没有基础病，而且有明显的家族肝癌病史的患者，建议可以选择干扰素试一试，因为长效干扰素除了具有抗病毒的作用机制之外，还有免疫调节的作用，能够激发患者的机体免疫应答，实现乙肝表面抗原的转阴。虽然目前疗效并不能达到100%，但是几率较用核苷类似物明显提高很多。