对于急性乙型肝炎一般恢复期为4周左右，最长可达到半年，如果半年表面抗原未得到阴转，可以诊断为慢性乙型肝炎。
10%的成人感染乙肝病毒后可能转为慢性肝炎，而90%可以完全治愈。病人的免疫能力、感染乙肝病毒的基因型以及是否得到合理治疗，决定恢复的时间，极少数病人可自然转阴。对于身体状态差的急性乙型肝炎病人，易发展为重症肝炎，恢复较慢，甚至需要半年时间来恢复。对于基因型为C型和D型的乙肝病毒感染者，恢复时间也比较长。
大多数的急性乙型肝炎是不需要抗病毒治疗，而对于病毒载量高，长时间不能得到转阴，并且基因型为C型和D型的患者，需要口服抗病毒药物，更有利于表面抗原的转阴。对于慢性乙型肝炎的病人，需要定期进行相关的检查，如果在活动期确定可以进行抗病毒治疗，要积极给予抗病毒药物治疗。抗病毒药物包括干扰素和核苷类抗病毒药。抗病毒的疗效评估，决定患者是否有机会临床治愈。
