海狗丸属于非处方类中成药，按照说明书推荐的用法用量，辨证合理使用是比较安全的，副作用不大。偶见患者服药后出现恶心、呕吐、胃部烧灼感等胃肠道反应。一般症状较为轻微，且为一过性的，不会影响治疗。极个别患者会出现皮疹、瘙痒等过敏反应，对此药过敏者禁用。
需要注意，此药药性温热，久服容易出现上火的症状，故不可擅自超说明书用药。服药2周症状无缓解，应去医院就诊。如需要继续服用，必须在医生的指导下进行。
感冒发热病人以及有阴虚火旺、实热证的患者是不宜服用的。为保证用药的效果，服药期间忌辛辣、生冷、油腻食物。心脏病、肝病、肾病等慢性病患者，应在医生的指导下服用。
海狗丸具有温肾助阳的功效，多用于治疗肾阳虚引起的腰膝酸软、神疲乏力、肢体困倦、怕冷、夜尿频多、气喘。此药补益作用较强，对胃肠道刺激作用小。饭前服用可以减少，食物对药物吸收的影响，提高药物的生物利用度，因此一般建议饭前服用。
