肺囊腺瘤目前临床暂无特效药，以手术治疗为主，手术治疗为先天性肺囊腺瘤的有效治疗手段。

手术治疗是该病的首选治疗方案，随着腔镜技术的不断发展，小儿胸腔镜肺叶切除术已经成为治疗小儿先天性肺囊腺瘤的常见手术方式。其手术对象范围也较广，从体重接近成人的大龄儿童到只有几公斤的新生儿都适用。

通过手术切除病变的肺组织可有效改善患儿的病情，具体预后视患儿病情发展而定。