小肠重复畸形的并发症有以下几点：

1、肠扭转：由于重复肠管的重力作用及被拉长的肠系膜扭转，可出现急性、完全性、绞窄性肠梗阻症状及体征。多发生于新生儿及婴幼儿。发病急，症状重，呕吐、腹痛剧烈，腹部常可触及扭转的包块；

2、肠套叠：位于回肠远端及回盲部的肠内囊肿型重复畸形易诱发肠套叠。重复畸形所致肠套叠无论行气压或水压灌肠，多不能使套头部复位。偶尔经灌肠复位成功后，腹部仍有包块，在B超下仍见囊性肿物；

3、腹膜炎：由于迷生的胃黏膜及胰腺组织对肠壁的腐蚀作用导致肠穿孔而致。穿孔部位均有异位胃黏膜，并已形成溃疡，且穿孔位于溃疡底部。临床为急性腹膜炎的症状及体征，在乳幼儿体征可能不明显，不易与急性阑尾炎穿孔区别。需耐心、仔细对比检查。