头皮长红疙瘩主要是针对致病菌的治疗，根据导致头皮长红疙瘩的病原体进行处理。若出现炎症导致的发热也需对症治疗。

一、药物治疗

1、抗生素类药物

主要针对各种细菌感染引起的毛囊炎所致的头皮长红疙瘩，外用药物主要包括莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏、复方多粘菌素B软膏、克林霉素凝胶等；口服药物常用头孢呋辛、阿莫西林、多西环素等。

2、抗真菌类药物

可用于真菌感染引起的头皮长红疙瘩，外用药物有酮康唑乳膏或洗剂、咪康唑霜、益康唑霜、克霉唑霜等；口服用药包括伊曲康唑、氟康唑、特比萘芬等。

二、手术治疗

一般很少用到手术治疗，但晚期化脓、破裂溃疡时可切开引流，排出脓液。

三、物理治疗

超短波、远红外线照射、光动力治疗等，具有消炎、镇痛及抗感染的作用。