指甲凹凸不平可由于某些生理性或病理性因素所致。其中，生理性因素主要和年龄有关，病理性因素多和真菌感染有关，如灰指甲（甲癣）。

一、疾病因素

1、真菌感染性疾病

因感染导致指甲变黄、增厚、凹凸不平，临床常见于灰指甲、甲沟炎等。

2、银屑病

银屑病患者指甲也会出现小凹坑，患者皮肤上会有红斑鳞屑皮疹，该病主要和遗传和免疫异常有关。

3、甲营养不良

病因多种多样，可和遗传、感染、免疫异常、肿瘤、外伤、营养不良、贫血等众多因素有关，通常累及多个甲，甚至所有手指和脚趾甲，可表现为甲板浑浊、变薄、变厚、易碎、横沟、纵脊、凹坑、表面粗糙、无光泽或变黄、变白等。

二、非疾病因素

1、营养不良

长期饥饿、营养不良也可以引起指甲凹凸不平。

2、年龄增长

40岁以上的中老年男性容易出现生理性甲竖纹，属于指甲正常的老化现象。

3、外伤

挤压伤、挫裂伤等，可导致指甲凹凸不平。