蛋白S偏低的治疗根据其原发病不同，也有所不同，具体如下。

1、遗传性PS缺陷症无特殊治疗治疗方法，应用肝素、双香豆素、纤维蛋白溶解剂等抗凝或溶栓药物，有助于预防体内血栓形成或阻止血栓在血管内发展。

2、肝硬化采取综合治疗，包括病因治疗，合理饮食、注意休息等一般对症支持治疗，以及预防和治疗各种并发症。

3、肝炎需要根据具体类型给予相应药物，主要为对症处理，包括保肝、降酶、利胆和退黄，此外给以充足的休息、适当营养支持，以及避免饮酒、过劳和使用损害肝脏药物。

4、急性呼吸窘迫综合征主要治疗措施包括积极治疗原发病、氧疗、机械通气、调节液体平衡等。

5、弥散性血管内凝血的治疗原则为序贯性、及时性、个体性及动态性，主要治疗包括基础疾病的处理及诱因清除、抗凝及抗血小板治疗、凝血因子补充、抗纤溶疗法、溶栓治疗及对症处理等。

6、维生素K缺乏症应给予维生素K，可口服，亦可肌内注射或静脉给药，若出血严重，可输注新鲜冷冻血浆。