结肠小袋纤毛虫属小袋科、动基裂纲，是人体内最大的寄生性原虫。于1857年首次从两名痢疾患者的粪便中发现了该虫，当时定名为结肠草履虫。

1、形态：结肠小袋纤毛虫有滋养体和包囊两个生活史阶段。滋养体呈椭圆形或卵圆形，无色透明或淡灰略带绿色，大小为(30-150)μm×(25-120)μm。

虫体外被表膜，有许多斜纵形的纤毛活的滋养体可借助纤毛的摆动作快速旋转式运动。虫体富弹性，极易变形。

滋养体前端有一凹陷的胞口下接漏斗状胞咽，颗粒状食物借胞口纤毛的运动进入虫体，形成食物泡经消化后，残渣经虫体后端的胞肛排出体外。虫体中、后部各有一伸缩泡，具有调节渗透压的作用。

苏木素染色后可见一个肾形的大核和一个圆形的小核，后者位于前者的凹陷处。包囊圆形或卵圆形，直径40-60μm，呈淡黄或浅绿色，囊壁厚而透明，染色后可见一明显的腊肠型大核。

2、生活史：包囊随污染的食物或水经口进人宿主体内，在胃肠道脱囊逸出滋养体滋养体在结肠内定居，以淀粉、细菌及肠壁脱落的细胞为食，迅速生长，以横二分裂进行繁殖，在分裂早期虫体变长。

中部形成横缢并收缩，后面的个体另长出胞口，小核首先分裂，大核延长并在中部收缩形成两个核。然后从横缢处分开前面的收缩泡进入前面的子体，后端的收缩泡则进人另一子体。

刚形成的子体较母体小，通过接合生殖逐渐恢复至原来大小。在一定的条件下滋养体可侵犯肠壁组织。由于肠内理化环境的变化，一部分滋养体变圆，同时分泌成囊物质将虫体包围形成包囊包囊随粪便排出体外，包囊在外界不再进行分裂增殖。

滋养体若随粪便排出，也有可能在外界成囊，人体内的滋养体较少形成包囊。