蝇成虫体长4-14mm。呈暗灰、黑、黄褐、暗褐等色，或有蓝绿青、紫等金属光泽。全身被有鬃毛。

1、头部：呈球形或半球形。一对复眼大，通常雄蝇两眼间距离窄或相接，雌蝇较宽。头顶有3个单眼排成三角形。触角分3节，第3节最长，基部前外侧有1根触角芒。

非吸血蝇类的口器为舐吸式，由基喙、中喙和口盘(含1对唇瓣)成，基上有1对单节触须。口器可伸缩折叠，以口盘直接舐吸食物。吸血蝇类的口器为刺吸式，中喙较细长而坚硬，唇瓣退化，喙齿发达。

2、胸部：前、后胸退化，中胸特别发达。中胸背板上鬃毛的排列形式条纹特征是分类的依据。翅除短的前缘脉和亚前缘脉外，有6条不分支的纵脉和1条腋脉，其中第4纵脉末端的弯曲形状为分类鉴别特征。

翅基部有翅瓣和上、下腋瓣部分蝇下腋瓣不发达或退化。蝇足多毛，末端具爪爪垫各一对和一个刚毛状的爪间突。发达的爪垫密布纤毛，可分泌黏液具黏附作用并能携带病原体。

3、腹部：圆简形，末端尖圆。末端数节为外生殖器。卵生雌蝇有产卵又器，产卵时伸出。雄蝇外生殖器是蝇种鉴定的重要依据。