腰部疼痛的原因很多，常见的包括腰椎骨质增生、腰椎间盘突出、腰椎骨折、椎管狭窄和骨质破坏等，腰疼做磁共振（MRI）还是CT需要根据不同情况进行判断，不可一概而论。

CT和MRI都可以用于诊断腰椎间盘炎、腰椎退行性变、椎体骨髓水肿、椎管内病变、脊髓病变和神经根病变等，其中MRI能够提供更清晰的显示，结果相对比较准确。

对于肾脏病变，如肾结石和输尿管结石引起的腰疼，CT检查可以观察结石的大小和位置，而核磁共振检查可能无法显示这些病变。

此外，MRI检查的时间稍长，成本较高，并且有一定的禁忌证，而CT检查时间较短，费用较低，适用于外伤和重症患者。CT和MRI各有其优势和局限性，医生会根据患者的临床症状和需要选择合适的检查方法。