小便的时候偶尔疼，绝大多数见于泌尿系感染，或者是结石。
1、泌尿系感染：此类患者会感觉小便时疼痛，有的是经常发生，有时是偶尔疼痛。很多时候还会合并尿道分泌物，如尿道有白色、透明或黄色的分泌物。如果是黏稠、浓厚的尿道分泌物，不仅排尿的时候会疼痛，还可能会有传染的情况。
建议尽快去医院就诊，明确尿道炎症或感染的原因。这种尿道疼痛是感染导致的，通常需要有针对性地选择抗生素进行治疗。
2、结石：并不是所有尿道疼痛都是感染引起，小便时偶尔痛有可能是存在结石，如输尿管下段结石、尿道结石。患者需要做泌尿系超声或CT检查，结石小的时候多数通过多饮水、多运动，能够排出体外。
而结石如果>6mm，或是比较大的结石，则需要进行外科介入治疗，如尿道输尿管镜激光或体外震波碎石等方法，应根据结石的CT值来判定结石的硬度，从而选择最佳的治疗方案。
