上海交通大学医学院附属第九人民医院神经内科是上海市第一批市级脑卒中中心，是上海市首批神经内科住院医师和专科医师规范化培训基地之一，有黄浦、宝山和浦东三个院区，共78张核定床位和重症监护室，每年完成约14万人次左右门诊量，年收治住院病人3600例。各院区有独立的门急诊和病房，以及开展神经介入等各种诊疗项目的软硬件设备；各院区各有独立的神经电生理室，可以完成各种临床神经电生理检查。
科室现有上海交通大学教授1人，博士研究生导师1人，硕士研究生导师4人，医师36人（其中博士研究生毕业35位），其中高级职称12人，中级职称17人，初级职称5人，外籍顾问教授2位。多人分别担任中华医学会神经病学分会脑血管病学组成员、中国卒中学会神经介入分会委员，中国卒中学会新药评审委员会副主任委员，中国神经科学会上海分会理事、上海市医学会神经内科分会和行为医学分会以及中西医结合神经内科专科委员、上海市医学会脑电图与临床神经生理专科委员。
脑血管病的介入治疗、帕金森病的一站式诊疗、眩晕疾病诊治、三叉神经痛的微创经皮球囊压迫术、慢性硬膜下血肿的介入栓塞治疗、脑小血管病（CADASIL）的早期诊疗、痴呆和认知障碍、慢性难治性偏头痛、各类神经系统疾病的肉毒素治疗等是我院神经内科的各个发展较为均衡的特色亚专业。
近年来，科室在神经病学基础和临床研究方面发展迅速，目前承担国家自然科学基金项目9项，上海市科委重点项目5项，上海卫建委项目3项，交大项目7项，科研经费1000多万元。近年科室成员以第一或者通讯作者身份、先后在Neurology、Stroke、Journal Controlled release、Journal of Cachexia Sarcopenia and Muscle、The Journal of Headache and Pain、Advanced Health care Materials、Neurobiol Aging、Small Structure、Headache等国际著名杂志发表数十篇临床和基础研究论文。
作为全国的综合卒中中心，脑卒中的救治是本中心的的重点发展方向，进行各个院区的卒中救治的一体化建设，持续改进流程，不断降低卒中的死亡率和残疾率，提高患者的生活质量。同时，我们在帕金森病和痴呆、脑小血管病、癫痫、头痛头晕等各亚专业全面发展，为患者提供优质的服务。学科将立足于科技创新、强调转化医学理念,从经验医学向循证医学模式转变，提高临床诊疗水平和能力，服务患者。实施各类人才引育计划，促进科室成员全面发展。重视本科和研究生教学，为学科的未来培养优秀的青年人才。重视基础和临床科研，以临床科研和创新带动临床医疗，充分发挥本学科专业特色在国内相关领域的优势，发挥在国内的引领作用。积极参与社区健康宣教和义诊等各类活动，发挥本学科特色，为社区群众服务。
