目前儿童多动综合征的确切病因尚不清楚，可能与遗传因素、环境因素、脑内神经递质代谢障碍、心理社会因素等有关，而其好发人群主要是具有遗传易感性的儿童、受致病环境因素影响的儿童、在不良社会环境或家庭条件下成长的儿童。
1、遗传：本病具有家族聚集现象，患者双亲患病率20%，一级亲属患病率10.9%，二级亲属患病率4.5%。单卵双生子同病率51%-64%，双卵双生子同病率33%。寄养子研究发现患者血缘亲属中患病率高于寄养亲属的患病率，遗传度平均为0.76。部分多动症儿童的父母童年有多动症历史者较多，多动症儿童的同胞兄弟姐妹患该病机率比一般儿童高。多动症儿童幼年时多表现为兴奋挣扎、睡眠障碍、格外活泼、衣服易损等。
2、神经递质：近年来相继提出了多巴胺、去甲肾上腺素及5-羟色胺假说。患者血和尿中多巴胺和去甲肾上腺素功能低下，5-羟色胺功能亢进。
3、环境因素：包括产前、围生期和出生后因素。因各种疾病、中毒、缺氧等多种因素造成脑组织及其功能轻微改变，如孕早期母亲病毒感染、异常分娩、产时窒息、颅内出血，婴儿时期的中枢神经系统感染、脑外伤、铅或其他重金属中毒等各种情况引起的后遗症。
4、家庭和心理社会因素：父母关系不和，家庭破裂，教养方式不当，父母性格不良，母亲患抑郁症或分离性障得，父亲有反社会行为或物质成瘾，家庭经济困难，住房拥挤，童年与父母分离、受虐待，学校的教育方法不当以及社会风气不良等不良因素，均可能增加患病危险性。