对于面肌痉挛手术治疗，目前临床上可以选择显微血管减压手术，其属于微创的开颅手术。可以导致患者出现低颅压性头痛，由于手术过程中病人会出现脑脊液的丢失，特别是体质比较差、血压偏低的病人更容易出现低颅压性头痛。
病人还可以出现面瘫，由于在手术过程中导致面神经受损，可以出现一侧面部肌肉活动失灵。
面肌痉挛术后并发症还可以见于感染，因为属于开颅手术，可以出现感染、发烧以及局部伤口愈合不良等。临床上有一部分患者还可以出现听力下降，多是手术侧的听力下降。