女性用的内置性卫生棉条大多数不会引起妇科疾病，除非放置手法以及卫生条件不够好，造成上行性感染。也有可能由于卫生棉条的质量不过关，买到质量不好的卫生棉条，本身细菌菌落超标，放到阴道里面，尤其在来月经时，阴道本身是有菌的环境，月经血是非常好的培养基。因此，如果本身卫生棉条的质量不过关，本身就带有细菌，放置卫生棉条时没有清洗干净手指，本身有感染的因素，或者本身阴道有细菌感染，这种情况下都可能会导致细菌感染。
感染会出现分泌物有臭味，所以如果是在月经期或者月经后放置卫生棉条以后，发现分泌物有异常气味，出现有外阴瘙痒、烧灼样疼痛。如果出现腹痛、发烧的现象，更说明是有炎症的感染。这种情况首先要将卫生棉条取出，同时还要进行阴道分泌物的检测，必要时给予药物治疗。