包括胃体部的胃肠道间质瘤，在其治疗中，提倡采用以手术切除治疗和靶向药物口服治疗相结合的方法。首先要明确肿瘤是否可以实施手术切除，以完整的病灶切除治疗为首选，可以最大程度的切除肿瘤，降低肿瘤负荷，为后续的靶向药物治疗提供条件。近年来，以伊马替尼为代表的靶向治疗药物，在胃肠道间质瘤的治疗上取得了明显的治疗疗效，部分已经可以取代手术被一线推荐。恶性肿瘤治疗上的其他治疗方法，如化学药物治疗、放射治疗、免疫治疗等治疗胃肠道间质瘤的有效率均较低，疗效也较差，一般不作为临床推荐使用。