扁桃体的作用是具有免疫功能。扁桃体位于口腔两侧，是外界细菌病毒等入侵时的门户，儿童时期扁桃体是活跃的免疫活性器官，可产生淋巴细胞，发挥体液免疫和一定的细胞免疫功能。当外界致病菌侵入人体时，扁桃体的淋巴细胞释放浆细胞、巨噬细胞和肥大细胞，这些细胞可吞噬消灭外来致病菌，防止进一步侵入人体。扁桃体反复受感染后会形成一病灶，容易诱发炎症反应。