菌血症是指局部细菌感染之后，细菌进入到血液循环做短暂的停留，然后随着血流进入到组织和器官当中，可以回到原来的损伤部位，也可以播散到其他的组织、器官，但是在血液当中不进行繁殖，与败血症有明显的区别。
败血症是指细菌进入到血循环当中，细菌在血液循环中进行繁殖，然后再播散到各个器官，病情相对来说比较重。菌血症是细菌在血液当中一过性短暂停留，细菌不繁殖，所以它带来的后果相对比败血症要轻得多。