益生菌在很多患有霉菌性阴道炎的女性里是很缺乏的，当用了益生菌以后80%的女性会受益。益生菌在局部用药对女性有益处，但是益生菌如果口服，由于大量的益生菌会参与整个人体肠道的各种菌群的竞争，可能会引起一系列胃肠道的症状，比如腹胀或者便秘。如果是免疫缺陷的病人，可能吃了益生菌以后会使免疫缺陷的疾病更加严重。有一部分人对益生菌会有过敏反应，但是益生菌如果在阴道局部应用，原则上不会出现太大的问题。